En virtud de su excelente sensibilidad y selectividad, la técnica de GC-MS/MS es muy utilizada para el análisis de residuos de pesticidas en alimentos. El número de pesticidas importantes crece en forma constante, superando ya los 300 compuestos. Por las limitaciones en la sensibilidad de detección y en la funcionalidad del software relacionado con el MRM, el análisis de tantos pesticidas exige que los compuestos buscados se dividan en múltiples archivos de métodos y luego se midan método por método. Como resultado, el número de análisis crece y termina afectando la productividad del laboratorio.

La función de creación de métodos Smart MRM en el software GCMSsolution permite generar automáticamente los métodos óptimos para el análisis en simultáneo de más de 400 compuestos, manteniendo la sensibilidad y la exactitud. Además, los análisis MRM pueden iniciarse sin tener que configurar los problemáticos ajustes de transición, mediante la utilización de la "Smart Pesticides Database" (Base de datos Inteligente de Pesticidas), que contiene parámetros de adquisición de 479 compuestos. Dado que esta base de datos contiene índices de retención, se puede corregir los tiempos de retención con un análisis independiente de n-alcano (función AART). Utilizar los tiempos de retención corregidos permite al usuario crear métodos MRM sin necesidad de un estándar analítico.