EDX y FTIR son ampliamente utilizados de manera individual para el análisis de materia contaminante, pero recientemente estos instrumentos se utilizan cada vez más en tándem. El uso de ellos en conjunción permite una elucidación más detallada de las características de los contaminantes, mejorando así la validez de los respectivos resultados.

El método analítico y el método de pretratamiento de la muestra dependen del grado en el que se vaya a caracterizar, independientemente de si la sustancia se altera o se destruye debido al pretratamiento, y la velocidad que se requiere para completar el análisis. Aquí se presenta un ejemplo del análisis real de los diversos tipos de materias extrañas introducidas durante el proceso de fabricación de alimentos.